直系同源定义为:A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列

直系同源的核心定义是不同物种中因共同祖先而产生的同源序列。解题关键在于区分直系同源与旁系同源：

1. 直系同源强调跨物种，由共同祖先直接遗传，如人类与黑猩猩的某基因。
2. 旁系同源则由基因复制产生，存在于同一物种内，如人类的α和β珠蛋白基因。
   选项中需排除同一物种内的选项（C、D）及结构相似但非祖先关系的选项（B）。

选项分析

A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列

• 正确。直系同源的本质是不同物种间的同源关系，且必须来源于共同祖先。

B. 具有较小的氨基酸一致性但有较大的结构相似性的同源序列

• 错误。结构相似但序列差异大，可能属于远缘同源或旁系同源，与直系同源无关。

C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列

• 错误。此为旁系同源的定义，与直系同源的跨物种特性矛盾。

D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列

• 错误。描述的是旁系同源的功能特点，仍属于同一物种内。