原位杂交可以用于组织、细胞中某种病菌和病毒等病原体的检测。

原位杂交是一种分子生物学技术，其核心原理是利用标记的探针与组织或细胞中的特定核酸（DNA或RNA）序列进行特异性结合。该技术的关键在于保持样本的空间结构，因此可以准确定位病原体在组织或细胞中的分布。题目考查对原位杂交应用场景的理解，需明确其检测病原体核酸的能力。

原位杂交的检测流程如下：

1. 固定样本：将组织或细胞固定，保持其原有结构。
2. 探针设计：根据目标病原体（如病毒、细菌）的特异性核酸序列设计探针。
3. 杂交反应：探针与样本中的目标核酸结合，通过显色或荧光标记显示位置。
4. 结果分析：观察显微镜下信号，判断病原体是否存在及分布。

结论：原位杂交能直接检测病原体的核酸，因此可用于检测病菌和病毒。