分子生物学与生物化学的区别体现在A. 前者研究生物大分子的形态,后者研究生物大分子的结构B. 前者研究生物分子间相互关系，后者研究生物分子间的物质能量转换过程C. 前者研究生物大分子的结构,后者研究生物小分子的功能D. 前者研究核酸的结构和特征,后者研究蛋白质的结构和功能

步骤 1：理解分子生物学和生物化学的定义
分子生物学是研究生物大分子（如核酸、蛋白质等）的结构、功能及其相互作用的科学。生物化学是研究生物体内的化学物质、化学反应及其能量转换过程的科学。
步骤 2：分析选项
A. 前者研究生物大分子的形态，后者研究生物大分子的结构。这个选项不正确，因为分子生物学和生物化学都研究生物大分子的结构。
B. 前者研究生物分子间相互关系，后者研究生物分子间的物质能量转换过程。这个选项正确，因为分子生物学研究生物大分子的相互作用，而生物化学研究生物分子间的物质和能量转换过程。
C. 前者研究生物大分子的结构，后者研究生物小分子的功能。这个选项不正确，因为生物化学也研究生物大分子的结构。
D. 前者研究核酸的结构和特征，后者研究蛋白质的结构和功能。这个选项不正确，因为分子生物学和生物化学都研究核酸和蛋白质的结构和功能。
步骤 3：选择正确答案
根据以上分析，正确答案是B。