依据《化工和危险化学品生产经营单位重大生产安全事故隐患判定标准（试行）》，涉及重点监管危险化工工艺的装置未实现自动化控制，系统未实现紧急停车功能，装备的自动化控制系统、紧急停车系统未投入使用,应当判定为重大事故隐患。A. 正确B. 错误

根据《化工和危险化学品生产经营单位重大生产安全事故隐患判定标准（试行）》的规定，涉及重点监管危险化工工艺的装置未实现自动化控制，系统未实现紧急停车功能，装备的自动化控制系统、紧急停车系统未投入使用，这些情况都属于重大事故隐患。这是因为自动化控制和紧急停车功能是确保化工生产安全的重要措施，如果这些系统未投入使用，将大大增加发生重大生产安全事故的风险。