不属于根管系统的为A. 根管B. 根管侧枝C. 管间吻合D. 副根管E. 根分叉

步骤 1：定义根管系统
根管系统是指牙齿内部的管道系统，包括根管、根管侧枝、管间吻合和副根管等结构，它们共同构成牙齿内部的通道，用于输送营养物质和神经。
步骤 2：分析选项
A. 根管：是牙齿内部的主要管道，用于输送营养物质和神经。
B. 根管侧枝：是根管的分支，用于输送营养物质和神经。
C. 管间吻合：是根管之间的连接，用于输送营养物质和神经。
D. 副根管：是根管的分支，用于输送营养物质和神经。
E. 根分叉：是牙齿根部的分叉，不属于根管系统。
步骤 3：确定答案
根据定义和分析，根分叉不属于根管系统。