有机认证的基本要求中,不得使用A. 基因工程B. 投入品C. 转换期D. 生产单元E. 环境认证

步骤 1：理解有机认证的基本要求
有机认证是一种确保农产品或食品在生产过程中遵循特定的有机农业标准的认证。这些标准通常包括不使用化学合成的农药、化肥、生长调节剂和转基因生物等。

步骤 2：分析选项
A. 基因工程：基因工程涉及使用生物技术手段来改变生物体的遗传物质。有机农业标准通常禁止使用基因工程产品，因为它们不符合有机农业的自然和生态原则。
B. 投入品：有机农业允许使用某些天然或有机认证的投入品，如有机肥料和生物农药。
C. 转换期：转换期是指从传统农业向有机农业过渡的时期，通常需要几年时间。在转换期内，农民需要逐步减少化学合成物质的使用。
D. 生产单元：生产单元是指进行有机农业生产的农场或企业。有机认证通常要求生产单元遵循有机农业标准。
E. 环境认证：环境认证是指对生产过程的环境影响进行评估和认证。有机认证通常包括对环境影响的评估，但环境认证本身不是有机认证的基本要求。

步骤 3：确定正确答案
根据有机认证的基本要求，基因工程产品是被禁止使用的。因此，正确答案是A。