现代发酵工程不仅包括___和___还包括___

现代发酵工程不仅包括传统的菌体生产和代谢产物的发酵生产，还包括微生物机能的利用。这些方面共同构成了现代发酵工程的完整体系，涵盖了微生物在工业、医药、环保等领域的广泛应用。