动物补检不合格，出具检疫处理通知单，由农业农村部门监督货主对动物进行无害化处理。A. 正确B. 错误

本题考查对动物检疫不合格处理流程的掌握。关键点在于明确农业农村部门在检疫不合格时的职责，即出具检疫处理通知单并监督无害化处理。需结合《中华人民共和国动物防疫法》相关内容理解。

根据《中华人民共和国动物防疫法》规定：

1. 检疫不合格的动物，农业农村部门需出具检疫处理通知单。
2. 无害化处理是强制措施，必须由农业农村部门监督货主执行，防止疫病传播。

题目描述完全符合法律规定，因此正确。