come () 发现......A. up withB. out ofC. intoD. upon

本题考查知识点：动词短语的固定搭配。
解题思路：需要了解每个选项与“come”组成的短语的含义，然后根据“发现......”这一语义来选择合适的短语。
解析：

• 选项A：“come up with”表示“提出；想出”，例如“He came up with a good idea.（他想出了一个好主意。）”，不符合“发现......”的意思。
• 选项B：“come out of”表示“从……出来”，例如“He came out of the room.（他从房间里出来了。）”，与“发现......”的语义不相符。
• 选项C：“come into”表示“进入；开始”，例如“He came into the house.（他进入了房子。）”，也不是“发现......”的意思。
• 选项D：“come upon”有“偶然遇见；发现”的意思，例如“I came upon an old friend in the street.（我在街上偶然遇到了一位老朋友。）”，符合题目中“发现......”的语义。