下列哪些因素是我国土壤肥力下降的根本原因?A. 长期过度施用化肥B. 有机肥投入不足C. 耕作制度不合理，如连作D. 土壤中微生物活性增强

本题考查我国土壤肥力下降的根本原因相关知识点。解题思路是对每个选项进行分析，判断其是否会导致土壤肥力下降。

• 选项A：
  长期过度施用化肥会带来诸多问题。一方面，化肥中养分比例失调，会使土壤中某些元素过度积累，而另一些元素相对缺乏，破坏土壤养分的平衡。另一方面，过度施用化肥会导致土壤板结，影响土壤的通气性和透水性，阻碍根系的生长和呼吸，从而降低土壤肥力。所以长期过度施用化肥是土壤肥力下降的根本原因之一。
• 选项B：
  有机肥含有丰富的有机质、养分和有益微生物等。它可以改善土壤结构，增加土壤的保水保肥能力，提高土壤的缓冲性能。当有机肥投入不足时，土壤中有机质含量会逐渐降低，土壤结构变差，保水保肥能力下降，进而导致土壤肥力下降。因此，有机肥投入不足是土壤肥力下降的根本原因之一。
• 选项C：
  不合理的耕作制度，如连作，会使土壤中某些养分过度消耗。因为不同作物对养分的需求不同，连作同一种作物会持续消耗土壤中特定的养分，导致土壤养分失衡。同时，连作还可能引发病虫害的积累，影响作物的生长和土壤的健康，最终导致土壤肥力下降。所以耕作制度不合理，如连作是土壤肥力下降的根本原因之一。
• 选项D：
  土壤中微生物活性增强通常是有利于土壤肥力提高的。微生物可以分解有机质，释放养分，促进土壤中养分的循环和转化，改善土壤结构等。所以土壤中微生物活性增强不是土壤肥力下降的原因。