根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》，同一时期，不同的超限运输申请，涉及对同一公路设施采取加固、改造措施的，由各承运人按照()的原则分担有关费用。 A. 公平、自愿B. 平等、互利C. 互利、合作D. 平等、自愿

步骤 1：理解问题背景
根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》，当同一时期内，不同的超限运输申请涉及对同一公路设施采取加固、改造措施时，需要确定由各承运人分担有关费用的原则。

步骤 2：分析选项
A. 公平、自愿：这一原则强调费用分担的公平性和自愿性，符合法规中对费用分担的要求。
B. 平等、互利：这一原则强调平等和互利，但没有明确提到费用分担的公平性和自愿性。
C. 互利、合作：这一原则强调互利和合作，但没有明确提到费用分担的公平性和自愿性。
D. 平等、自愿：这一原则强调平等和自愿，但没有明确提到费用分担的公平性。

步骤 3：选择正确答案
根据法规要求，费用分担应遵循公平和自愿的原则，因此选项A是正确的。