《宗教事务条例》第三条规定，宗教事务管理坚持的原则是(）。A. 互相尊重，互不干涉，团结和睦，有利稳定B. 求同存异，团结多数，把握方向，稳步推进C. 保护合法，制止非法，抵御渗透，打击犯罪D. 保护合法，制止非法，遏制极端，抵御渗透，打击犯罪

步骤 1：理解《宗教事务条例》第三条的内容
《宗教事务条例》第三条是关于宗教事务管理的基本原则，需要明确其具体内容和含义。

步骤 2：分析选项
A. 互相尊重，互不干涉，团结和睦，有利稳定：这一选项强调的是尊重和团结，但没有涉及对非法宗教活动的管理。
B. 求同存异，团结多数，把握方向，稳步推进：这一选项强调的是团结和方向，但没有涉及对非法宗教活动的管理。
C. 保护合法，制止非法，抵御渗透，打击犯罪：这一选项强调了对合法宗教活动的保护，对非法宗教活动的制止，以及对渗透和犯罪的打击。
D. 保护合法，制止非法，遏制极端，抵御渗透，打击犯罪：这一选项强调了对合法宗教活动的保护，对非法宗教活动的制止，对极端宗教活动的遏制，以及对渗透和犯罪的打击。

步骤 3：选择正确答案
根据《宗教事务条例》第三条的内容，宗教事务管理坚持的原则是保护合法，制止非法，遏制极端，抵御渗透，打击犯罪。因此，正确答案是D。