根据《中华人民共和国密码法》，违反第二十八条实施进口许可、出口管制的规定，进出口商用密码的，由()依法予以处罚。A. 国务院商务主管部门或者海关B. 海关C. 商务主管部门D. 密码管理部门

本题考查《中华人民共和国密码法》中关于商用密码进出口违规行为的处罚部门。核心要点在于明确法律条文中规定的具体执法主体。需注意，商用密码的进出口管理涉及商务主管部门和海关的协同监管，而非单一部门负责。

根据《中华人民共和国密码法》第三十七条的规定，违反第二十八条关于商用密码进出口许可、管制规定的，由国务院商务主管部门或海关依法予以处罚。

• 商务主管部门负责外贸政策的制定与监管，海关负责实际进出口环节的查验。两者均属于有权机关，需共同执行相关法律。
• 密码管理部门（选项D）主要负责密码工作的统筹管理，不直接参与违规行为的处罚。
• 选项B、C仅列出单一部门，与法律原文中“或者”的表述不符。