随着革命形势的迅速发展，在中共滇西工委祥云分委会辖区内，各个大小不等的游击根据地逐步形成，从1949年夏季起，中共祥云分委先后在 ( ) 等地建立了根据地党政工作机构。A. 南山区B. 东山区C. 哨区D. 三姚地区

在1949年夏季，随着解放战争形势的迅速发展，中共祥云分委会在其辖区内逐步建立根据地党政工作机构。结合历史地理与革命根据地分布特征，南山区是当时祥云地区革命力量活跃、根据地建设重点发展的区域。

南山区地处祥云县南部，地形复杂、群众基础较好，是中共滇西工委及祥云分委会开展游击战争、建立政权的重要区域。从革命实践来看，南山区成为建立党政工作机构的优先区域，便于领导群众、组织武装、巩固根据地。

而东山区、哨区、三姚地区在1949年夏季并非祥云分委会建立根据地党政机构的主要区域，或尚未形成稳定政权结构，或属于后续解放区域。

因此，从历史发展脉络与根据地建设逻辑判断，中共祥云分委会在南山区率先建立根据地党政工作机构。

答案：

A.南山区