保密行政管理部门收缴非法获取,持有的国家秘密载体,应当进行登记并出具清单,查清密级,()等,并采取相应的保密措施。A. 数量B. 来源C. 扩散范围D. 以上都有

本题考查对保密行政管理部门收缴国家秘密载体程序的掌握。关键点在于理解收缴过程中需要查清的要素，包括密级、数量、来源、扩散范围等，这些信息对后续调查和处理至关重要。正确选项需包含所有必要内容。

根据《中华人民共和国保守国家秘密法》及其实施条例，收缴非法持有的国家秘密载体时，必须：

1. 登记并出具清单，确保记录完整；
2. 查清密级，明确涉密等级；
3. 数量，掌握载体总量；
4. 来源，追查非法获取途径；
5. 扩散范围，评估泄密影响。

选项D“以上都有”全面覆盖上述要素，因此正确。