新生儿先天性巨结肠最常见的并发症是A. 肠梗阻B. 肠穿孔C. 败血症D. 出血E. 小肠结肠炎

步骤 1：了解先天性巨结肠的定义
先天性巨结肠是一种先天性疾病，其特征是结肠的一部分缺乏神经节细胞，导致该部分结肠无法正常蠕动，从而引起便秘和肠梗阻。

步骤 2：了解并发症
先天性巨结肠的并发症包括肠梗阻、肠穿孔、败血症、出血和小肠结肠炎。其中，小肠结肠炎是最常见的并发症，表现为发热、腹胀、呕吐和腹泻等症状。

步骤 3：确定最常见的并发症
根据临床观察和研究，小肠结肠炎是先天性巨结肠最常见的并发症，因此答案为E。