感染髓腔内细菌主要存在A. 根管口B. 根尖孔C. 主根管D. 侧枝根管E. 牙本质小管

感染髓腔内细菌主要存在于主根管。主根管是牙齿内部的主要通道，细菌可以通过这个通道进入髓腔，导致感染。其他选项如根管口、根尖孔、侧枝根管和牙本质小管虽然也可能存在细菌，但它们不是细菌进入髓腔的主要途径。