根据《标准施工招标文件》中的通用条款，承包人按合同约定提交的最终结清申请单中，只限于提出()。A. 在合同工程接收证书颁发前B. 在合同工作接收证书颁发后C. 在竣工付款证书接收前D. 在缺陷责任期终止证书颁发后

步骤 1：理解最终结清申请单的定义
最终结清申请单是承包人在合同工程接收证书颁发后，向发包人提交的用于最终结算的文件。它包含了承包人认为在合同执行过程中应得到的最终付款请求。

步骤 2：确定最终结清申请单的索赔范围
根据《标准施工招标文件》中的通用条款，承包人按合同约定提交的最终结清申请单中，只限于提出在合同工程接收证书颁发后发生的索赔。这意味着在合同工程接收证书颁发之前发生的索赔，承包人应在其他阶段提出，而不是在最终结清申请单中提出。

步骤 3：确认最终结清申请单的索赔时间点
最终结清申请单中的索赔时间点是在合同工程接收证书颁发后，即在工程接收证书颁发之后，承包人可以提出索赔。这表明在工程接收证书颁发之前，承包人应已经处理了所有相关的索赔问题。