医疗机构供临床直接使用的房屋建筑存在以下()情形的,属于医疗机构重大事故隐患。A. 未委托具有相应资质等级设计单位提出设计方案,擅自变动房屋建筑主体和承重结构。B. 房屋地基基础不稳定、出现明显不均匀沉降。C. 房屋承重构件存在明显损伤、裂缝或变形,随时可能丧失稳定和承载能力。D. 房屋内不够干净整洁。

步骤 1：理解问题背景
医疗机构的房屋建筑安全是保障患者和医护人员安全的重要因素。因此，医疗机构的房屋建筑存在重大事故隐患时，需要及时发现和处理。
步骤 2：分析选项
A. 未委托具有相应资质等级设计单位提出设计方案，擅自变动房屋建筑主体和承重结构。这可能导致房屋结构不稳定，存在安全隐患。
B. 房屋地基基础不稳定、出现明显不均匀沉降。这可能导致房屋结构不稳定，存在安全隐患。
C. 房屋承重构件存在明显损伤、裂缝或变形，随时可能丧失稳定和承载能力。这可能导致房屋结构不稳定，存在安全隐患。
D. 房屋内不够干净整洁。这虽然影响环境，但不直接涉及房屋建筑的安全隐患。
步骤 3：确定答案
根据上述分析，A、B、C选项都涉及房屋建筑的安全隐患，而D选项不涉及安全隐患。