医师在医疗活动中应尊重患者自主权，但若患者自主权对他人和社会造成危害，医师应该采取的措施有:A. 报告医院相关部门处理B. 限制患者人身自由和不当选择C. 尊重患者的自主选择D. 禁止患者行使自主权E. 对患者不当选择进行必要限制

步骤 1：理解患者自主权
患者自主权是指患者有权在医疗活动中做出自己的决定，包括选择治疗方案、拒绝治疗等。这是尊重患者个人权利和尊严的重要体现。
步骤 2：识别患者自主权对他人和社会的危害
当患者自主权的行使可能对他人或社会造成危害时，如传染病患者拒绝隔离治疗，可能对公共健康造成威胁，此时需要考虑采取措施限制患者的自主权。
步骤 3：采取必要措施
在患者自主权对他人和社会造成危害的情况下，医师应采取必要措施，如对患者不当选择进行必要限制，以保护公共利益和他人健康。