根据《国务院关于投资体制改革的决定》,对于采用直接投资和资本金注入方式的政府投资项目,政府投资主管部门需要审批的文件有( )。A. 资金申请报告B. 可行性研究报告C. 初步设计和概算D. 项目申请报告E. 项目建议书

步骤 1：理解政府投资项目审批流程
根据《国务院关于投资体制改革的决定》，对于采用直接投资和资本金注入方式的政府投资项目，政府投资主管部门需要审批的文件包括项目建议书、可行性研究报告和初步设计和概算。这些文件是项目决策和实施的重要依据。

步骤 2：分析选项
A. 资金申请报告：资金申请报告是企业向政府申请资金支持的文件，不是政府投资主管部门需要审批的文件。
B. 可行性研究报告：可行性研究报告是政府投资主管部门需要审批的文件之一，用于评估项目的可行性。
C. 初步设计和概算：初步设计和概算是政府投资主管部门需要审批的文件之一，用于确定项目的具体设计和预算。
D. 项目申请报告：项目申请报告是企业向政府申请项目审批的文件，不是政府投资主管部门需要审批的文件。
E. 项目建议书：项目建议书是政府投资主管部门需要审批的文件之一，用于提出项目的初步设想和建议。

步骤 3：选择正确答案
根据上述分析，政府投资主管部门需要审批的文件包括可行性研究报告、初步设计和概算、项目建议书。因此，正确答案是B、C、E。