依据建设线路安规，在深山密林中施工应防止误踩深沟、陷阱。应穿硬胶底鞋。不得穿越不明深浅的水域和薄冰，同时应随时与其他人员保持联系。作业完毕，（ ）应清点人数。A. 施工负责人B. 作业人员C. 项目经理D. 安全员

步骤 1：理解背景信息
在深山密林中施工时，由于环境复杂，存在许多潜在的危险，如深沟、陷阱等。因此，需要采取一些安全措施，如穿硬胶底鞋，避免穿越不明深浅的水域和薄冰，同时保持与其他人员的联系。
步骤 2：确定清点人数的责任人
作业完毕后，需要清点人数以确保所有人员安全。根据题目中的选项，施工负责人、作业人员、项目经理和安全员都有可能承担这一责任。但根据安全管理和责任分配的原则，施工负责人通常负责整个施工过程的安全管理，包括人员的清点。
步骤 3：选择正确答案
根据上述分析，施工负责人应负责清点人数，以确保所有人员安全。