代理国库集中支付业务资金清算，包括（）等。A. 财政零余额账户与国库单一账户清算B. 预算单位零余额账户与国库单一账户清算C. 财政性资金在本行内部清算D. 财政性资金跨系统银行间清算

本题考查代理国库集中支付业务资金清算的内容。解题思路是需要对每个选项所涉及的资金清算情况进行分析，判断其是否属于代理国库集中支付业务资金清算的范畴。

选项A

财政零余额账户是财政部门在商业银行开设的用于财政直接支付的账户。在国库集中支付业务中，财政部门通过财政零余额账户向供应商支付款项后，该账户余额为零，随后财政零余额账户与国库单一账户进行清算，将支付的资金从国库单一账户划转到财政零余额账户，以保证财政零余额账户的正常支付功能。所以财政零余额账户与国库单一账户清算是代理国库集中支付业务资金清算的一部分。

选项B

预算单位零余额账户是预算单位在商业银行开设的用于财政授权支付的账户。预算单位通过预算单位零余额账户向供应商支付款项后，账户余额为零，之后预算单位零余额账户与国库单一账户进行清算，将支付的资金从国库单一账户划转到预算单位零余额账户，以维持预算单位零余额账户的支付能力。因此，预算单位零余额账户与国库单一账户清算是代理国库集中支付业务资金清算的内容。

选项C

在代理国库集中支付业务中，财政性资金可能会在同一银行的不同分支机构或者不同账户之间进行内部流转和清算。例如，财政部门或预算单位在同一银行的不同网点办理业务，资金需要在本行内部进行调配和清算，以确保资金的准确和及时到账。所以财政性资金在本行内部清算是代理国库集中支付业务资金清算的一部分。

选项D

当财政性资金的支付涉及不同银行系统时，就需要进行跨系统银行间清算。比如，财政部门或预算单位通过一家银行向另一家银行的供应商账户支付款项，此时就需要通过人民银行的清算系统等进行跨系统的资金清算，以实现资金在不同银行之间的顺利划转。所以财政性资金跨系统银行间清算是代理国库集中支付业务资金清算的内容。