工程款支付证书由（）签发。A. 总监理工程师B. 专业监理工程师C. 监理员D. 施工单位项目负责人

本题考查的是工程款支付证书的签发主体相关知识点。解题思路是明确在工程建设监理流程中，不同岗位人员的职责权限，根据相关规定来判断哪个岗位人员有权签发工程款支付证书。
在工程建设项目中，总监理工程师是监理单位派驻工程项目的总负责人，全面负责工程项目的监理工作，包括对工程进度、质量、投资等方面的控制。工程款支付涉及到工程投资的控制，是一项重要的工作，需要具有较高决策权和权威性的人员来签发。
专业监理工程师主要负责本专业的监理工作，如对工程质量、进度等进行具体的监督和检查，但通常不具备签发工程款支付证书的权限。
监理员主要是在专业监理工程师的指导下，进行一些具体的现场监理工作，如检查施工质量、记录工程进度等，更没有签发工程款支付证书的权力。
施工单位项目负责人主要负责施工单位在项目中的各项施工管理工作，其职责是组织施工、保证工程质量和进度等，而不是签发工程款支付证书。
所以，工程款支付证书应由总监理工程师签发。