某建设单位经主管部门批准，组织某建设项目的公开招标工作。根据项目的实际情况和建设单位要求，考虑到各种因素的影响，决定该工程在基本方案确定后即开始招标，确定的招标程序如下： (1)成立该工程招标领导机构； (2)委托招标代理机构代理招标； (3)发出投标邀请书； (4)对报名参加投标者进行资格预审，并将结果通知合格的申请投标人； (5)向所有获得投标资格的投标人发售招标文件； (6)召开投标预备会； (7)招标文件的澄清与修改； (8)建立评标组织，制定标底和评标、定标办法； (9)召开开标会议，审查投标文件； (10)组织评标； (11)与合格的投标者进行质疑澄清； (12)决定中标单位； (13)发出中标通知书； (14)建设单位与中标单位签订承发包合同。指出上述招标程序中的不妥和不完善之处。

步骤 1：成立招标领导机构
成立该工程招标领导机构是招标程序中的第一步，这是合理的。

步骤 2：委托招标代理机构代理招标
委托招标代理机构代理招标是合理的，可以确保招标过程的专业性和公正性。

步骤 3：发出投标邀请书
发出投标邀请书不妥，应为发布招标公告。因为是公开招标，应该向所有潜在投标人发布招标公告，而不是仅向特定的投标人发出投标邀请书。

步骤 4：对报名参加投标者进行资格预审
对报名参加投标者进行资格预审是合理的，可以确保投标人的资格符合要求。

步骤 5：将资格预审结果仅通知合格的申请投标人
将资格预审结果仅通知合格的申请投标人不妥，资格预审的结果应通知到所有申请投标人。这样可以确保所有申请投标人都能了解自己的资格预审结果。

步骤 6：向所有获得投标资格的投标人发售招标文件
向所有获得投标资格的投标人发售招标文件是合理的，可以确保所有合格的投标人都能获得招标文件。

步骤 7：召开投标预备会
召开投标预备会是合理的，可以解答投标人在阅读招标文件时的疑问。

步骤 8：招标文件的澄清与修改
招标文件的澄清与修改是合理的，可以确保招标文件的准确性和完整性。

步骤 9：建立评标组织，制定标底和评标、定标办法
建立评标组织，制定标底和评标、定标办法是合理的，可以确保评标过程的公正性和科学性。

步骤 10：召开开标会议，审查投标文件
召开开标会议，审查投标文件是合理的，可以确保投标文件的完整性和准确性。

步骤 11：组织评标
组织评标是合理的，可以确保评标过程的公正性和科学性。

步骤 12：与合格的投标者进行质疑澄清
与合格的投标者进行质疑澄清是合理的，可以确保评标过程的公正性和科学性。

步骤 13：决定中标单位
决定中标单位是合理的，可以确保中标单位的资格符合要求。

步骤 14：发出中标通知书
发出中标通知书是合理的，可以确保中标单位的资格符合要求。

步骤 15：建设单位与中标单位签订承发包合同
建设单位与中标单位签订承发包合同是合理的，可以确保合同的合法性和有效性。