二重感染是指：A、多种细菌引起的感染B、多种致病微生物引起的感染C、多种特殊厌氧菌引起的感染D、机体抵抗力下降引起反复的细菌感染E、抗生素应用过程中耐药菌株引起的感染

步骤 1：定义二重感染
二重感染是指在使用抗生素治疗原发感染的过程中，由于抗生素的使用导致正常菌群失调，从而使得耐药菌株或条件致病菌大量繁殖，引起新的感染。
步骤 2：分析选项
A、多种细菌引起的感染：这描述的是多菌感染，而不是二重感染。
B、多种致病微生物引起的感染：这描述的是多微生物感染，而不是二重感染。
C、多种特殊厌氧菌引起的感染：这描述的是厌氧菌感染，而不是二重感染。
D、机体抵抗力下降引起反复的细菌感染：这描述的是免疫力低下导致的反复感染，而不是二重感染。
E、抗生素应用过程中耐药菌株引起的感染：这描述的是二重感染的定义。
步骤 3：选择正确答案
根据二重感染的定义，正确答案是E。